蛋白质质谱分析技术根据质谱检测的直接对象可以分为“自上而下”、“自中而下”以及“自下而上”三种策略。“自上而下”策略直接分析完整的蛋白质；“自中而下”和“自下而上”策略都是通过质谱分析蛋白质酶解消化得到的肽段进而实现完整蛋白质的分析，“自中而下”策略可以分析的肽段长度范围比“自下而上”策略稍大一些。
蛋白酶切后质谱检测属于传统的“自中而下”或“自下而上”策略范畴，在这种分析方法中，通常选择多种不同的蛋白酶对蛋白质进行多重酶解，经过肽段之间的拼接完成蛋白序列1_0_0_%的测定。通过质谱鉴定酶解得到的肽段来实现完整蛋白质分析的策略是目前zuì成熟的蛋白质组学研究方法，广泛用于各种蛋白质的定性定量表征、蛋白质翻译后修饰鉴定以及蛋白质相互作用研究等，常见的Label Free、TMT、SILAC以及iTRAQ等都是通过研究肽段来实现完整蛋白含量鉴定的技术。
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北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。
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