申请提供互联网药品信息服务，向网站主办单位所在地省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门提出申请的同时，提交以下材料：
（一）企业营业执照复印件。
（二）网站域名注册的相关证书或者证明文件。从事互联网药品信息服务网站的中文名称，除与主办单位名称相同的以外，不得以“中国”“中华”“全国”等冠名；除取得药品招标代理机构资格证书的单位开办的互联网站外，其他提供互联网药品信息服务的网站名称中不得出现“电子商务”“药品招商”“药品招标”等内容。
（三）网站栏目设置说明（申请经营性互联网药品信息服务的网站需提供收费栏目及收费方式的说明）。
（四）网站对历史发布信息进行备份和查阅的相关管理制度及执行情况说明。
（五）食品药品监督管理部门在线浏览网站上所有栏目、内容的方法及操作说明。
（六）药品及医疗器械相关专业技术人员学历证明或者其专业技术资格证书复印件、网站负责人身份证复印件及简历。
（七）健全的网络与信息安全保障措施，包括网站安全保障措施、信息安全保密管理制度、用户信息安全管理制度。
（八）保证药品信息来源合法、真实、安全的管理措施、情况说明及相关证明。
四、《互联网药品信息服务资格证书》申请流程（一）申请企业，须先登录国家食品药品监督管理总局行政事项受理服务页，“新建申请”进行网上填报公司基本信息。
国家食品药品监督管理总局网站
基本信息填报完毕后，会生成国家食品药品监督管理局统一制发的《互联网药品信息服务申请表》，同时生成企业ID号，可以打印/修改基本信息。
（二）完成第一步之后，按照各省市食品药品监督管理部门网上公布的互联网药品信息服务申请服务指南或者直接咨询各省市食品药品监督管理部门相关要求，准备申请材料。
（三）申请材料准备齐备后，根据各省市食品药品监督管理部门的不同要求，或者网上申报，或者窗口提交。各省市食品药品监督管理部门在收到申请材料之日起5日内会做出受理与否的决定，受理的，发给受理通知书；不受理的，通知申请人并说明理由。对于申请材料不规范、不完整的，一般会一次告知需要补正的全部内容。
（四）自受理之日起20日内，各省市食品药品监督管理部门会对申请材料进行审核，并作出同意或者不同意的决定。同意的，核发《互联网药品信息服务资格证书》，同时报国家食品药品监督管理总局备案并发布公告；不同意的，会书面通知申请人并说明理由。