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季铵盐类消毒剂：常用的有新洁尔灭、洗必泰、度米芬、消毒净、百毒1杀等。分子结构中的疏水基团可渗入细1菌胞浆膜和蛋白质层，使细1菌的通透性发生变化．导致菌体内的酶、辅酶和代谢产物外漏．妨碍细1菌的呼吸及糖酵解过程，晋城消毒剂，并使细1菌蛋白变性，山西消毒剂，具有杀菌浓度低、毒性和刺激性小、无腐蚀和漂白作用、水溶性好、性质稳定等优点，在低浓度下抑菌．高浓度时杀灭大多数细1菌繁殖体和部分病毒，但对结核杆1菌、绿脓杆1菌、芽孢和大部分病毒的杀灭效果较差。
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醛类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性或烷1基化；杀菌特点是对细1菌、芽孢、真1菌、病毒均有效。但温度影响较大。如甲醛、戊2醛等。该类消毒剂可做灭菌剂使用。
酚类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性、沉淀或使酶系统失活；杀菌特点是对真1菌和部分病毒有效。
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实际养殖过程中，消毒剂品类繁多，有中草1药类消毒剂；过氧化物类消毒剂；染料类消毒剂； 季铵盐类消毒剂；重金属盐类； 酸、碱、盐类消毒剂；酚、醛、醇类消毒剂；含氯、碘消毒剂。养殖户要有针对性的选择水产消毒剂。
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