1、性质不同，CNAS认可是机构的自愿行为。CMA是政府的强制性认行政许可。
2、适用对象不同，CNAS适用对象是第一、二、三方实验室，以及将检测和/或校准作为检查和产品认证工作一部分的实验室。CMA适用于第三方检测机构。
3、适用范围不同，CNAS是国际互认的。CMA在中国国境内有效，对社会出具具有公正证明作用。
4、管理机构、评审机构不同，CNAS由中国合格评定认可委员会进行评审和管理。CMA由CNCA（中国国家认证认可监督管理委员会）、各省、市、自治区、直辖市人民政府质量技术监督部门进行评审和管理工作。